يسعى المركز الوطني للموارد المائية لأن يكون مركز وطني رائد في البحث والرصد وتقييم موارد المياه، ولتحقيق هذا الهدف، يجري العمل على تدعيم المركز بموارد بشرية وفنية ومادية تُمكّنه من إجراء أبحاث موسعة وشاملة حول موارد المياه وتوفير معلومات موثوقة وشاملة، كميا ونوعيا، عن المياه.